MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanococcus maripaludis X1 chromosome

Total Repeats: 41563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015847	T	7	7	2	8	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015847	AT	3	6	36	41	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015847	TAAAA	2	10	55	64	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015847	CCA	2	6	90	95	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015847	AGG	2	6	119	124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015847	GGGAT	2	10	142	151	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015847	CTC	2	6	161	166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_015847	TTAAA	2	10	190	199	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015847	TCT	2	6	324	329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015847	GCT	2	6	421	426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015847	CAG	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015847	CAAC	2	8	532	539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015847	ACG	2	6	547	552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015847	CTG	2	6	608	613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015847	T	6	6	708	713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015847	CAA	2	6	790	795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015847	GGCT	2	8	801	808	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015847	CCT	2	6	863	868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015847	AGG	2	6	880	885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015847	GTG	2	6	955	960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015847	CCG	2	6	1225	1230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015847	AC	3	6	1299	1304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015847	AT	3	6	1378	1383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015847	CCT	2	6	1564	1569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_015847	TCA	2	6	1580	1585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015847	TTA	2	6	1605	1610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015847	AAG	2	6	1747	1752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015847	CGG	2	6	1819	1824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015847	TAC	3	9	1852	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015847	C	6	6	1924	1929	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_015847	CGG	2	6	1961	1966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015847	GCT	2	6	2039	2044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015847	CTG	2	6	2060	2065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015847	CGA	3	9	2186	2194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015847	TTC	2	6	2227	2232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015847	ACC	2	6	2238	2243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_015847	AGA	2	6	2356	2361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015847	CAA	2	6	2375	2380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015847	TTG	2	6	2504	2509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015847	CCTACG	2	12	2515	2526	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015847	CAA	2	6	2551	2556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015847	GAC	2	6	2585	2590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015847	CATAC	2	10	2665	2674	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_015847	CG	3	6	2798	2803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015847	AAG	2	6	2919	2924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015847	TAA	2	6	2988	2993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015847	CCAAG	2	10	3165	3174	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_015847	ATA	2	6	3274	3279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015847	TAG	2	6	3328	3333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015847	T	7	7	3346	3352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015847	AGG	2	6	3353	3358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015847	C	6	6	3404	3409	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_015847	AAGGCC	2	12	3438	3449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015847	GTG	2	6	3469	3474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015847	GT	3	6	3484	3489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015847	TAT	2	6	3518	3523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015847	TAC	2	6	3534	3539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015847	TCCT	2	8	3700	3707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015847	GGA	2	6	3749	3754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015847	CAC	2	6	3837	3842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_015847	GTC	2	6	3863	3868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015847	TCA	2	6	3879	3884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015847	GGC	2	6	4001	4006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015847	GGT	2	6	4168	4173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015847	CAG	2	6	4240	4245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015847	CCA	2	6	4334	4339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_015847	GCT	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015847	C	6	6	4449	4454	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_015847	CTG	2	6	4488	4493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015847	CT	3	6	4542	4547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015847	TGG	2	6	4572	4577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015847	CCA	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_015847	TAT	2	6	4674	4679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015847	CGG	2	6	4801	4806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015847	TAG	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015847	ATA	2	6	4969	4974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015847	TA	3	6	5021	5026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015847	AT	3	6	5113	5118	50 %	50 %	0 %	0 %	340623185
79	NC_015847	A	6	6	5158	5163	100 %	0 %	0 %	0 %	340623185
80	NC_015847	TGA	2	6	5164	5169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623185
81	NC_015847	AT	3	6	5195	5200	50 %	50 %	0 %	0 %	340623185
82	NC_015847	CTT	2	6	5213	5218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623185
83	NC_015847	TTG	2	6	5223	5228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623185
84	NC_015847	AGA	2	6	5231	5236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623185
85	NC_015847	A	8	8	5244	5251	100 %	0 %	0 %	0 %	340623185
86	NC_015847	GAA	3	9	5258	5266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623185
87	NC_015847	CGGATG	2	12	5317	5328	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340623185
88	NC_015847	ATA	2	6	5420	5425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
89	NC_015847	A	8	8	5428	5435	100 %	0 %	0 %	0 %	340623186
90	NC_015847	GAA	2	6	5448	5453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623186
91	NC_015847	GAA	2	6	5501	5506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623186
92	NC_015847	AAT	2	6	5561	5566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
93	NC_015847	CTT	2	6	5628	5633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623186
94	NC_015847	AAT	2	6	5650	5655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
95	NC_015847	TGGAA	2	10	5743	5752	40 %	20 %	40 %	0 %	340623186
96	NC_015847	AGA	2	6	5773	5778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623186
97	NC_015847	TC	3	6	5782	5787	0 %	50 %	0 %	50 %	340623186
98	NC_015847	TGA	2	6	5794	5799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623186
99	NC_015847	GAA	2	6	5852	5857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623186
100	NC_015847	TGCA	2	8	5860	5867	25 %	25 %	25 %	25 %	340623186
101	NC_015847	ATA	2	6	5870	5875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
102	NC_015847	T	6	6	5906	5911	0 %	100 %	0 %	0 %	340623186
103	NC_015847	GAT	2	6	5912	5917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623186
104	NC_015847	CTT	2	6	6029	6034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623186
105	NC_015847	AT	3	6	6062	6067	50 %	50 %	0 %	0 %	340623186
106	NC_015847	AAT	2	6	6106	6111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
107	NC_015847	AAT	2	6	6149	6154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
108	NC_015847	A	6	6	6210	6215	100 %	0 %	0 %	0 %	340623186
109	NC_015847	A	7	7	6224	6230	100 %	0 %	0 %	0 %	340623186
110	NC_015847	TAA	2	6	6246	6251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
111	NC_015847	A	6	6	6250	6255	100 %	0 %	0 %	0 %	340623186
112	NC_015847	TCA	2	6	6257	6262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623186
113	NC_015847	GAA	2	6	6263	6268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340623186
114	NC_015847	AATT	2	8	6270	6277	50 %	50 %	0 %	0 %	340623186
115	NC_015847	TGA	2	6	6397	6402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623186
116	NC_015847	TAA	2	6	6408	6413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
117	NC_015847	ATA	2	6	6436	6441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340623186
118	NC_015847	TAA	2	6	6442	6447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015847	A	7	7	6446	6452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015847	T	7	7	6462	6468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015847	T	6	6	6472	6477	0 %	100 %	0 %	0 %	340623187
122	NC_015847	AATT	2	8	6479	6486	50 %	50 %	0 %	0 %	340623187
123	NC_015847	CCA	2	6	6516	6521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340623187
124	NC_015847	ACT	2	6	6537	6542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623187
125	NC_015847	TGGAAA	2	12	6641	6652	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340623187
126	NC_015847	AT	3	6	6669	6674	50 %	50 %	0 %	0 %	340623187
127	NC_015847	GT	3	6	6711	6716	0 %	50 %	50 %	0 %	340623187
128	NC_015847	ATC	2	6	6794	6799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623187
129	NC_015847	TTC	2	6	6826	6831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623187
130	NC_015847	GT	3	6	6845	6850	0 %	50 %	50 %	0 %	340623187
131	NC_015847	CTG	2	6	6853	6858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340623187
132	NC_015847	TGG	2	6	6935	6940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340623187
133	NC_015847	TCT	2	6	6969	6974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340623187
134	NC_015847	ACT	2	6	7014	7019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623187
135	NC_015847	TC	3	6	7023	7028	0 %	50 %	0 %	50 %	340623187
136	NC_015847	TCA	2	6	7044	7049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623187
137	NC_015847	TGA	2	6	7127	7132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340623187
138	NC_015847	CAT	2	6	7184	7189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340623187
139	NC_015847	GCT	2	6	7203	7208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340623187
140	NC_015847	TTG	2	6	7321	7326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340623187
141	NC_015847	ATT	2	6	7362	7367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340623187
142	NC_015847	TCC	2	6	7475	7480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340623187
143	NC_015847	ATT	2	6	7578	7583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015847	TA	3	6	7632	7637	50 %	50 %	0 %	0 %	340623188
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